تزخر مكتبة المعهد العالى لحضارات الشرق الأدنى القديم بالعديد من الكتب والمراجع والبحوث والرسالة العلمية السخية والثرية بالمادة العلمية منها العام والخاص فى مجالات حضارات الشرق الأدنى القديم وتشتمل على سبيل المثال لا الحصر على كتب تخص حضارات العراق وشبه الجزيرة العربية وبابل والأندلس وحضارات المصرية القديمة وبلاد الشام والأناضول باللغتين العربية والانجليزية.لخدمة الطلاب في مرحلة الدراسات العليا والباحثين و هيئة التدريس.
ان مكتبة المعهد قد تكونت على مدار تاريخ المعهد الذى تاسس منذ عام ١٩٨٨ وتضم مجموعات فريدة ومهمة من المؤلفات العلمية فى علوم حضارات الشرق الادنى القديم (الحضارة المصرية القديمة وشبه الجزيرة العربية والعراق وايران والشام والاناضول.) مما يجعلها تنفرد بتخصصاتها التى يعكسها تفرد المعهد فى المنطقة العربية.