تزخر مكتبة المعهد العالى لحضارات الشرق الأدنى القديم بالعديد من الكتب والمراجع والبحوث والرسالة العلمية السخية والثرية بالمادة العلمية منها العام والخاص فى مجالات حضارات الشرق الأدنى القديم وتشتمل على سبيل المثال لا الحصر على كتب تخص حضارات العراق وشبه الجزيرة العربية وبابل والأندلس وحضارات المصرية القديمة وبلاد الشام والأناضول باللغتين العربية والانجليزية.