يعد المعهد العالى لحضارات الشرق الأدنى القديم من المعاهد العلمية الفريدة ليس على مستوى مصر فحسب بل على مستوى منطقة الشرق الاوسط ، وهو يهتم بقراءة تاريخ تلك المنطقة التى كانت مهبطا للديانات السماوية والتى شهدت اقدم الحضارات الانسانية فى تاريخ العالم القديم . ويضم المعهد متحفا يعتبر من افضل المتاحف الاكاديمية ، ويضم بين جنباته اكثر من 2500 اثر بعضها يعتبر من الآثار النادرة التى تم استخراجها من خلال ذلك المشروع الطموح الذى قامت به جامعة الزقازيق ،وهو مشروع الحفائر الأثرية فى منطقة تل بسطة ( بر- باست ) منذ عام 1978 م والذى استمر حتى عام 1998 م بالاضافة إلى منطقة كفور نجم – مركز الابراهيمية بمحافظة الشرقية منذ عام 1984م . ونامل من الله العلى القدير إن تؤدى الدراسة فى هذا المعهد إلى زيادة الروابط والتاخى بين شعوب المنطقة ، وان نضيف خطوة تلو الخطوة على الطريق الحضارى الذى انتهجته وتنتهجه مصر على مدى العصور كدولة رائدة فى دفع عجلة التطور الانسانى والحضارى .